Lebenslauf
Lebenslauf
Postdoktorand für Systemmedizin und mathematische Biologie in Dresden. Hintergrund in biomedizinischer Technik und Maschinenbau.
Ausbildung
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2021 – 2025
Promotion, Mathematik
Technische Universität Dresden · CIDS & ZIH
Mit magna cum laude abgeschlossen. Dissertation: Modeling Cell Plasticity at the Invasive Edge to Control Glioblastoma Recurrence. Betreut von Prof. Axel Voigt und Prof. Haralampos Hatzikirou, in der IMC-Gruppe von Prof. Andreas Deutsch. Verteidigt im Juli 2025.
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2015 – 2018
M.Sc., Biomedizinische Technik (Biomechanik)
Tabriz University of Technology, Iran
Abschlussarbeit: Simulation der Wirkstoffabgabe bei Leberkrebs und in gesundem Gewebe unter Berücksichtigung der Mikrovaskulatur.
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2009 – 2015
B.Sc., Maschinenbau
Shahrood University of Technology · Wärme- und Strömungstechnik
Abschlussarbeit: Simulation zweidimensionaler viskoser Fingerbildung in porösen Medien.
Beruflicher Werdegang
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Seit Nov. 2025
Postdoktorand für Bioinformatik
Medizinische Klinik III · Universitätsklinikum Carl Gustav Carus Dresden / TU Dresden · Vollzeit
- Integration großer UK-Biobank-Multi-Omics-Daten — Proteomik, Metabolomik, Genomik — mit klinischen Variablen
- Entwicklung prädiktiver Modelle für den Krankheitsverlauf bei Adipositas, Prädiabetes, Typ-2-Diabetes und MASLD
- Verbindung von maschinellem Lernen und mechanistischer Modellierung für interpretierbare Vorhersagen
- Untersuchung molekularer Signaturen und Signalwege bei Stoffwechsel- und Lebererkrankungen
- Analyse von Risikofaktoren für schwere Komplikationen — kardiovaskuläre Ereignisse, Nephropathie, Infektionen, Zirrhose
- Entwicklung einer Anwendung zur Digitalisierung der hauseigenen Biobankdaten und zur Erleichterung ihrer Auswertung
- Zusammenarbeit mit Kliniken und interdisziplinären Teams zur Unterstützung translationaler Forschung
- Pflege reproduzierbarer, ethisch geregelter und FAIRer Analysepipelines
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Okt. 2024 – Sep. 2025
Wissenschaftlicher Mitarbeiter, Gruppe DataMedAssist
Fakultät Informatik / Mathematik, HTW Dresden · Teilzeit
- Entwicklung eines KI-Frameworks zur Vorhersage des Zustands von Tumorsphäroiden aus radiomischen Merkmalen
- Vorhersage des Zeitpunkts, an dem Sphäroide der Therapiekontrolle entkommen
- Aufbau von Bildverarbeitungspipelines, die dem stark nichtlinearen Verhalten der Sphäroide standhalten
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März 2021 – Juli 2025
Doktorand
Technische Universität Dresden · CIDS & ZIH
- Entwicklung und Verfeinerung mathematischer Modelle der Gliom-Makrophagen-Interaktion
- Durchführung von Simulationen virtueller Patienten als In-silico-Studien
- Unsicherheits- und globale Sensitivitätsanalysen der vorgeschlagenen Modelle
- Erprobung Bayesscher Ansätze, die mechanistische Modelle mit maschinellem Lernen verbinden
- Auswertung multimodaler Radio-Omics-Daten zur Vorhersage der Zeit bis zum Rezidiv
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März 2018 – März 2021
Freier Wissenschaftler, Übersetzer und Gutachter
Selbstständig
- Aufbau von Expertise in Data Science, statistischer Analyse und maschinellem Lernen
- Publikationen zu Wirkstoffabgabe und Hyperthermie in der Krebstherapie
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Sep. 2016 – März 2018
Wissenschaftlicher Mitarbeiter, Advanced Biofluids Laboratory
Sahand University of Technology
- Entwicklung mathematischer Modelle der Wirkstoffverteilung in soliden Tumoren
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Juni 2017 – Sep. 2017
Forschungskooperation, Biological Engineering Laboratory
Universität Teheran
- Patientenspezifische Modellierung der Hämodynamik zerebraler Aneurysmen
Kenntnisse & Mitgliedschaften
Mitgliedschaften
- DZD
- Deutsches Zentrum für Diabetesforschung
- IRTG 3019
- MEDIS — internationales Graduiertenkolleg, Dresden & Zürich
- CIDS
- Center for Interdisciplinary Digital Sciences, TU Dresden
Technische Kenntnisse
Data Science & maschinelles Lernen
- Python
- R
- scikit-learn
- TensorFlow
- NumPy / SciPy / pandas
- Deep Learning
- Überlebenszeitanalyse
- Bayessche Inferenz
- Biostatistik
- Big Data
Biomedizinische Fachdomäne
- Proteomik & Omics-Analyse
- Bioinformatik
- Systembiologie
- Radiomik & Bildanalyse
- UK Biobank
- Agentenbasierte Modellierung
- Unsicherheitsquantifizierung
KI-Engineering & Werkzeuge
- LLM-APIs (OpenAI, Anthropic)
- Model Context Protocol
- Agenten-Orchestrierung
- Retrieval & Zusammenfassung
- Git
- CI / GitHub Actions
- Linux / HPC
- SQL
- Node / Next.js
- Forschungssoftware-Entwicklung
Simulation & Ingenieurwesen
- MATLAB
- COMSOL Multiphysics
- ANSYS
- Maple
- C++
Sprachen
- Persisch
- Muttersprache
- Englisch
- Verhandlungssicher · IELTS 7.0 (C1)
- Deutsch
- Gute Arbeitskenntnisse · Goethe-Zertifikat B2 (2024)
Vorträge & Poster
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2026 · Vortrag
IRTG 3019: MEDIS-Retreat
Universitätsspital Zürich & ETH Zürich
Glukosewerte und Infektionsrisiko unterhalb des klinischen Diabetesbereichs.
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Juli 2024 · Vortrag
ECMTB 2024
Universität Castilla-La Mancha, Toledo
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Juni 2024 · Vortrag
Workshop on Computational Models in Biology & Medicine
CRTD, Dresden
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März 2024 · Eingeladen
Institut für Medizinische Informatik und Biometrie
Universitätsklinikum Carl Gustav Carus, Dresden
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April 2023 · Poster
Max-Planck-Institut für Evolutionsbiologie
Plön
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Nov. 2022 · Poster
e:Med-Tagung zur Systemmedizin
Heidelberg
Gutachtertätigkeit & Auszeichnungen
Gutachtertätigkeit
Ich begutachte für:
- Nature Communications Medicine
- npj Systems Biology and Applications
- Scientific Reports
- Metabolism: Clinical and Experimental
- Frontiers in Oncology
- Frontiers in Medicine
- PLOS One
- PLOS Complex Systems
- PLOS Soft Matter
- Computer Methods and Programs in Biomedicine
- Computers in Biology and Medicine
- Physics of Fluids
Mitgliedschaften
- ESMTB
- European Society of Mathematical Biology
- SMB
- Society of Mathematical Biology
Auszeichnungen
- Promotionsstipendium, ERACoSysMed / BMBF, Deutschland
- Promotion mit magna cum laude, TU Dresden, 2025
- Ausgezeichnete interdisziplinäre Masterarbeit
- Best-Paper-Award, 3. Iranische Konferenz für Wärme- und Stofftransport (ICHMT), 2017
- Beste 4 % von mehr als 350.000 Teilnehmenden der landesweiten Hochschulaufnahmeprüfung
- Vollstipendium während des gesamten Bachelorstudiums
Lehre
Betreuung des Seminars in mathematischer Biologie — Mathematik innovativer Krebstherapien, TU Dresden, Sommersemester 2023.
Kontakt
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Ich arbeite mit Forschungsgruppen, Kliniken, Health-Tech-Teams und Bioinformatik-Teams an der Schnittstelle von Biologie, Datenwissenschaft und personalisierter Medizin — von einer einstündigen Einschätzung eines Studiendesigns bis zur vollständigen Modellierungskooperation.
Details
- pejman.shojaee@tu-dresden.de
- ORCID
- 0000-0003-3298-3315
- Standort
- Dresden, Deutschland
- Sprachen
- Englisch (C1) · Deutsch (B2) · Persisch (Muttersprache)